괴이 증후군 다운로드

잎과 괴 경 견본은 액체 질소의 밑에 균질이 고 총 rna는 rna 적 출 완충기 (38% 포화 된 석탄 산, pH 5.2; 0.8 m 구 아니 딘 thihocyate에서 두 조직 모두에서 추출 되었다; 0.4 m 염화 티 오시 안산 염; 0.1 m 나트륨 아세테이트; 5% 글리세롤 v/v). 샘플은 (밀리 모, 미국) 클로 포 름으로 세척 한 후, 이소고 강수량으로 청소 하였다. 샘플의 순도를 높이기 위해 추가 페 놀/클로로 포 름 단계는 isopanol 강수량 이후 도입 되었습니다. 3 μ g 총 rna는 denaturing agarose 젤에서 분리 되었다 (1.4% agarose, invitrogen, 미국; 0.7% 포름알데히드, 밀리 공, 미국) RNA의 완전성을 시험 하기 위하여. 총 RNA는 pstvd 성적 증명서의 탐지를 위한 0.45 μ m 나일론 막 (whatman, GE 헬스케어, UK)에 옮겨 졌다. rna (-)는 라벨을 붙인 조사 (파기 rna 상표를 붙이는 혼합, roche 진단, 스위스)에 의해 생산 되었다 T7 전사에서 hindiii 커트 pHa106 플라스 미드 [33] 그리고 교 잡은 밤새 껏 교 잡 완충기 (5x SSC; 1% SDS; 1x denhardt의 65 ° c에 실행 되었다; 250 mg/ml trna; 50% formide). 65 ° c에서 2x SSC/0.2% SDS를 가진 3 개의 연속적인 세척 후에, CDP 별 (roche 진단, 스위스)는 제조자 지시에 따라 탐지를 위해 이용 되었다. 악대 강렬은 소프트웨어 양 것으로 계량 되었다 4.4.1 (Biorad, 미국) 그리고 가치는 통제로 ribosomal 서브 유닛과 RNA (25s rrna)를 사용 하 여 각 식물을 위한 잎 견본에 정상화. 60k 감자 microarray를 사용 하 여 게놈 넓은 표정 학문은 우리가 비 갑 상선 감염의 일 찌 기 그리고 늦은 단계에서 미분 표정을 보여주는 유전자의 표정 수준을 시험 하는 것을 허용 했다. 이것은 부 갑 상선 감염에 연결 된 pathogenesis 관련 유전자를 찾기위한 귀중 한 데이터 세트 이지만, 우리의 주요 초점은 더 나은 변경 된 tuberization, 괴 경 모양 개발 및 이러한 생물 학적 프로세스에 영향을 미치는 유전자를 찾는 이해에 있습니다. 우리의 이전 연구는 높은 heteroozygous 전체 sib diploid 감자 인구 (06h1)를 사용 하 여 두 가지 주요 lomy 괴 경 모양에 대 한 분리 확인 [32]. 우리는 가장 높은 kruskal-월리스 (KW) 값을 보여 양적 특성 loci (qtl) 아래 염색체 2와 10에 두 개의 마커를 확인 길이에 인구에 있는 가변성에이 loi의 가장 높은 영향을 나타내기/폭 (LW) tubers의 비율 ( 모양).

infinium 8303 감자 배열에서 기인 하는이 단 하나 뉴클레오티드 다형성 (snp) 감 적은 염색체 2에 염색체 10 그리고 c2_46885를 위해 c1_8020. 우리는 이러한 마커를 포함 하 고 또한 이웃 supertits 슈퍼 건설을 확인 했다. 이 superscerolds에 있는 유전자는 괴 경 모양 대형 또는 tuberization (S4 테이블)에 있는 역할이 있을지도 모 르다 지 그들의 주석이 달린 기능에 따라 추출 되 고 시험 되었다. 비 갑 부의 마이크로 어레이 데이터 로부터 차동으로 발현 된 유전자는 이러한 유전자 집합과 비교 되 고 후보 유전자를 확인 하였다 (표 1). 흥미롭게도, 두 개의 유전자 염색체 10 qtl 아래 superbits에 차동 표현을 보여줍니다. 염색체 2의 3 개의 확인 한 supermolds에 비 갑 상선 감염에 미분 표정을 보여주는 8 개 유전자가 있다. 염색체 10에 후보자 유전자 그리고 그들의 주석이 달린 기능의 낮은 수 때문에 우리는 염색체 2에 있는 유전자에 더 집중 했다. tuberization는 지 하에 수정 된 줄기 (stolon)가 분화 하 고 붇는 것을 시작 될 때 특정 한 개발 과정, 몇몇 solanum 종에 유일한 괴 경을 개발 하기 위하여 이다 [14]. 감자는 괴 경 대형을 일으킬 수 있는 상대적으로 낮은 밤 온도 및 짧은 일에 적응 시키는 남아메리카에서 기인한 다 [15].